杨妙真宣布明教与军队分离之后，柯豪、陆冠英等七侠派出身的高层第一时间退教，于是便没有跟随杨妙真同上华山。
如今明教高层返回之后，军队已经重新编列，七位舵主各领一军。有人手下原本有两三万大军，如今却只有一万，自然有所不满，不过有的舵主原本部下不过数千，反而占了便宜，对此却极为支持。
如此一来不满的三位舵主也不好多说什么。
柯崇云知他们心有不满，为了安抚，便告诉他们，虽然他们几位舵主所帅人马一样多，但在官职上会让他们更高一些。
在柯镇恶的建议下，柯崇云将军中武官分为三等，既将、校、尉，每一等又分上、中、少三品，共九品，正好对应文官的九品，比之南宋武将五十三等精简了无数倍。
而对应军的正职长官本来为少将或中将，但大军初步整编，各职位本来以低品就任，也就是说，这二十个军的军长都应该是少将军衔，但是为了补偿三位军队削减了的舵主，所以直接让他们担任军长。
于是七位舵主便不再有异议了。
此刻柯崇云带着一众将领巡视军营，便是让各军军长挑选部曲。
除了柯豪的禁卫军外，其余十九军的实力基本均衡，各军军长所谓的挑选，也不过是个过场而已，其实军队中底层的将领早已经到位了，各军长履任之后些许的人事微调，只要不是太过分，其实影响不大。
等各军长熟悉了自己的部曲，这次部队改编便算是完成了。
二十支新军，加上北方孟珙统领的七万大军、襄阳一带两万余守军、哲别挥下一万蒙古骑兵、郭靖手下一万青海骑兵、关中的四万守军，以及驻守江淮的三万教兵，登州的近万水师，柯崇云挥下的正规军共计四十万。
等登基大典之后，开封城外的这二十万新军也会分别调往四方。
柯镇恶见儿子将军务处理的井井有条，心中颇为满意，便没有过去打扰。
到了晚上，柯崇云从军营返回城中，知道柯镇恶已经到了，忙又寻来拜见。
柯镇恶道：“我看你军队安排得颇为周到，文官这边又是如何安排的？”
柯崇云道：“按照爹你以前的提点，孩儿觉得有些地方尚有疑虑，与大伙商议之后，做了一些调整。我已经定下了大体方略，军政分离，这是第一条，等登基之后，我会建立军机处，以大将军统领三军；再设立行政院统管全国政务，以宰相统筹全局；其后便是大理寺，主管律法和审判，以大理寺卿为首；再设御史台，监察天下官员，收集百姓舆情，主官为御使中丞。”
柯镇恶点了点头，道：“没有三省六部和内阁么？”
柯崇云道：“三省就不必了，六部设在行政院下，至于内阁，我是想在四大主官之外再增加两三人，如此商议一些大事，就不必专设了。”
柯镇恶不置可否，又问道：“既然军机处与行政院并列，那兵部管什么？”
柯崇云道：“兵部主管军中钱粮军械，军政分离后，兵部便不需要再参赞军务，只要沟通好钱粮便可！”
柯镇恶道：“不如取消兵部，由军机处直接从行政院沟通钱粮，每年固定从财政调拨一定比列的钱粮，由军机处自行分派。或者军机处自行从各地筹集粮草。”
柯崇云道：“若如此，怕是三代之后便会出现唐时藩镇割据的局面。”
柯镇恶摇头道：“你没有明白我的意思，军机处既然独立在行政院之外，那么它便不单单是一个讨论作战的地方，军队官员的升降，钱粮的支取、军法的执行都要包含其中，否则几代之后，文武对立，军队必然受到遏制。”