主公所料兴军讨桓。
得到消息之后，暗潜在京口丁全直奔朱龄石家中，他曾随孟龙符与朱龄石在一起喝过酒。丁全将刘裕是杀死桓修主使告诉朱龄石，邀朱龄石前往襄阳。
朱龄石原本以为是何无忌杀人与刘裕无关，待得知实情披甲上马要去斩杀刘裕报仇。广陵刘毅等人率军赶至，朱龄石知道已无能为力，只得同丁全前往码头。
丁全将朱龄石送上黄富的船，继续留在京口不提。
京口、广陵起事一帆风顺，然而建康内应却出了问题。
刘裕听孟昶所言派人暗中联络刘迈在京中起事，刘迈应允，因他在京中地位高于王叡等人，王叡、王懿、辛扈兴、童厚之等人便推举刘迈为首领。
众人暗中商议，因为桓玄喜欢游猎，经常冒夜出入，可以找准机会暗杀。
二月二十六日，刘裕派陈留周安穆前往京城通知刘迈等人起义的时间，刘迈震惧不已，惊惶现于颜面。
周安穆见状，认为刘迈难以成事，迅速返还京口报告刘裕。
二月二十七日，朝庭下诏以刘迈为竟陵太守。刘迈思之再三，认为正好借机脱身，准备连夜乘船前往竟陵。
恰逢桓玄想了解北府军的情况，夜间让人送了封信给刘迈，问及北府军的情况，以及他最近见刘裕说了什么？
刘迈吓破了胆，以为阴谋已经泄露，第二天一早便入宫觐见，将刘裕等人要在京口、广陵、历阳等地起事反桓的情报全盘交待。
桓玄惊得魂飞魄散，从东宫返还西堂，命文武百官入居台省，急、诏桓谦、卞范之等亲信前来商讨平叛之事。
惊魂稍定，桓玄下旨加封刘迈为重安侯，命人前去抓拿同谋的王叡、辛扈兴、童厚之等人，王叡的弟弟王懿听到动静不对，乔装从后门逃脱。
等到王叡等人抓住，桓玄下令将刘迈与他们一起斩首，罪名是刘迈没有立刻抓住周安穆，心存观望，不知刘迈黄泉之下做如何想？
桓玄派出信使前往历阳，告知刁逵豫州参事诸葛长民将反，刁逵得信后拿住诸葛长民，关进监牢。
桓谦、卞范之赶到东堂，桓玄将刘裕等人起兵之事告知。桓谦建议火带发兵平定叛乱。
可是桓玄却想以逸待劳，屯军于覆舟山，等刘裕大军到来，届时再以水师偷袭京口，发动三吴士族袭扰京口后方，这样三面合围，刘裕不攻自破。
卞范之力谏不可，赞同桓谦出兵平乱的建议。桓玄下以扬州刺史、新安郡王桓谦为征讨都督，东兴县公殷仲文接替已死桓修为徐兖刺史，让顿丘太守吴甫之、右卫将军皇甫敷整顿兵马，准备攻打京口。
京口，众人齐聚刺史府大堂，推举刘裕为盟主，掌徐州事；以孟昶为长史，镇京口；檀凭之为司马；刘穆之为主薄；彭城主薄刘钟统率新投军的青壮。
刘裕传檄天下，历数桓玄篡逆，声称江州刺史郭昶之在寻阳拥立天子复位，益州刺史毛璩夺取江陵，雍州刺史杨安玄攻占梁州，镇北参军等人占据石头城，扬武将军诸葛长民夺取历阳。
二月二十九日，刘裕率军西进，占领竹里，山河风云突变，大战一触即发。
「注(1)：从官职上看，刘毅是征虏中兵参军属，应该是刘道规的麾下。
(2)：史书上记载刘裕起军不过一千七百余人，笔者认为是不实之言。刘裕统领兵马至少也在三至五千，京口、广陵是北府军驻地，就算北府军将领或逃或亡，普通兵马还在，若没有北府军将士响应，刘裕不可能真凭一千七百人攻打建康，而桓玄就算再无能，建康兵马也有数万之多，能够轻松剿灭广陵、京口起义。笔者猜测，刘裕至少有七八千兵马在手，加上新募的青壮应该超过万人。」
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