凭借着MW1里扎卡耶夫那极其煽动的名言和极富戏剧色彩的死亡，导致整个俄罗斯民粹化，俄罗斯人民不仅把扎卡耶夫当成了民族英雄，为其树立起了纪念碑，同时还用扎卡耶夫的名字冠名国际机场。在阿富汗，混蛋的事情(夏培德将军语)依然在继续着，过去的敌人变成了今天的兵员，游骑兵一员的Allen肩负起了训练阿富汗新兵的职责。他的一举一动被一旁的夏培德将军看在眼里，将军觉得他是自己用得上的棋子。还没等将军拉Allen执行自己的特殊任务，受到武装分子袭击的美军来基地搬救兵，于是我们的Allen义无反顾地上了悍马。
刚开始的阿富汗车队
一路上，夏培德阐述着自己关于现代战争的理解和自己的一套胜者为王的理念，说到热血之处，把普世价值吹得天花乱坠，而自己只是为了让世人明白这种价值的战争机器而已。河岸上，大义凛然的夏培德将军拉起Allen，说出了游骑兵当先的名言就一溜烟地跑掉了，Allen跟着车队，借着美军导弹炸掉为数不多的高层建筑的余威，一路杀过阿富汗小学，最终踏上了夏培德将军的直升机的阶梯。
在飞机上，夏培德将军二话不说把Allen划归到CIA的单位名下，同时告诉Allen你有幸将和地球最强特种部队141合作，而另外两位应该和你一队的队员现在在俄国冰天雪地里执行任务。没多久肥皂和我们的第二主角回报任务全部完成，再拿回ACS模块的同时，还毁掉了整个俄军基地。
俄罗斯基地
于是，夏培德将军提出自己对Allen要求的东西更多，夏培德将军要求Allen假扮俄军士兵，同时被安插在马克洛夫的身边，以便随时抓获马克洛夫。夏培德将军同时也大致交代了Allen另一部分属于CIA秘密权限的任务，那就是暂时成为马克洛夫的“朋友”，一起实施扎卡耶夫国际机场的恐怖袭击的任务，同时嫁祸给扎卡耶夫残党，以使俄罗斯政治变天。夏培德将军不无深情的说道，这是一场不计代价的交易，不管付出有多少，即使是你的生命，但是与你将要拯救的人相比，这些都不算什么。于是Allen就屁颠屁颠地去了俄罗斯，混入了马克洛夫的恐怖分子里。
在扎卡耶夫国际机场，对着Allen出色地完成了CIA部分的任务，给俄罗斯传递了一个扎卡耶夫残党所为的信号。因为马克洛夫曾经是扎卡耶夫的门徒，由他施行的恐怖活动自然算在扎卡耶夫残党身上。然后不知怎么的，马克洛夫在逃出升天的最后时刻，识破了Allen的CIA伪装，一枪干掉了Allen，他似乎是改变了原来发动恐怖袭击所要传递信号的初衷，自己给世界和俄罗斯留下了一个信号。那就是这场由扎卡耶夫的门徒领导的恐怖袭击背后实际上是CIA的杰作。
恐怖份子袭击机场
因为Allen的行为和身份，美国和141特别行动队的说辞再也没有人相信了，他们迫切需要一个足以让人信服的证据，于是顺着机场查获的Bullet，141特别行动队把武器提供者锁定在了巴西。他们希望透过Bullet找到武器提供商，并最终查到马克洛夫的地址，还自己一个清白也好，问清事情来龙去脉也好。